O PGENAM tem como objetivo principal formar profissionais de alto nível, que possuam não apenas uma visão acadêmica interdisciplinar, mas também contribuam para que a sociedade e o país possam lograr êxito em sua empreitada rumo ao cumprimento dos principais desafios do Século XXI. Estes devem ser alcançados em todos os segmentos sociais, particularmente o acadêmico e o empresarial, quais sejam a sustentabilidade, a interdisciplinaridade, a transversalidade e a inovação.
Um aspecto essencial no desenvolvimento da atividade do discente vinculado ao PGENAM é que, uma vez identificado o problema a ser tratado e estabelecida a hipótese de pesquisa, estes venham a ser explorados sob uma ótica interdisciplinar. O problema escolhido como tema de pesquisa é tratado sob perspectivas distintas e complementares.
Desta forma, o PGENAM contribui para a formação de pessoal qualificado, através de uma abordagem científica e metodológica de problemas envolvendo questões de energia e ambiente numa perspectiva interdisciplinar, contribuindo para o setor industrial, o setor acadêmico, e diversos órgãos governamentais ou da sociedade organizada, nos seus vários níveis. De outra forma, busca-se o contínuo atendimento das demandas do mercado e da sociedade para a compreensão e o uso adequado de recursos relacionados à energia e ambiente.